Основные задачи отдела аспирантуры:

• разработка нормативных документов по организации и управлению подготовкой кадров высшей квалификации в академии;
• планирование, организация и контроль учебного процесса в аспирантуре, повышение эффективности работы аспирантов, реализация мер по созданию условий для успешных диссертационных исследований;
• прикрепление соискателей ученой степени кандидата наук для подготовки и сдачи экзаменов кандидатского минимума;
• согласование с Департаментом научно-технологической политики и образования Министерства сельского хозяйства РФ вопросов, связанных с планом приема в аспирантуру и отчетам по деятельности аспирантуры.

Формирование научных и научно-педагогических кадров является все более важной задачей российского общества. В условиях расширения научного пространства от качества подготовки и аттестации научных кадров  зависит степень развития научного прогресса в стране. Подготовка специалистов высшей квалификации по праву признается  одной из наиболее развитых и приоритетных областей российской образовательной системы.

Основными формами подготовки научно-педагогических и научных кадров в системе высшего образования, предоставляющими гражданам Российской Федерации возможность повышения уровня образования, научной и научно-педагогической квалификации является аспирантура. Такое образование предоставляет гражданам возможность повышения уровня образования, научной, педагогической квалификации на базе высшего образования, подтвержденного дипломом специалиста или магистра.

Подготовка аспирантов в академии осуществляется по 6 направлениям.

Правила приема граждан на обучение по программам подготовки научно-педагогических кадров в аспирантуре регулируются Федеральным законом от 29 декабря 2012 г. № 273-ФЗ «Об образовании в Российской Федерации», другими федеральными законами и Порядком организации и осуществления образовательной деятельности по образовательным программам высшего образования - программам подготовки научно-педагогических кадров в аспирантуре, утвержденным приказом Министерства образования и науки Российской Федерации от 19 ноября 2013 г. N 1259.

Прием на обучение по программам подготовки научно-педагогических кадров в аспирантуре проводится по результатам вступительных испытаний.

Число обучающихся по имеющим государственную аккредитацию образовательным программам подготовки научно-педагогических кадров в аспирантуре за счет бюджетных ассигнований федерального бюджета определяется на основе контрольных цифры приема на обучение по направлениям подготовки за счет бюджетных ассигнований федерального бюджета.

Академия вправе проводить прием на обучение в аспирантуру по договорам об оказании платных образовательных услуг на программы подготовки научно-педагогических кадров в аспирантуре, имеющие лицензию на осуществление образовательной деятельности.